在癌癥研究領(lǐng)域,質(zhì)譜成像(MSI)是一種非常有前途的技術(shù),但目前該技術(shù)的運(yùn)用還受原始數(shù)據(jù)預(yù)處理、圖像精確度及圖像識(shí)別能力等問題限制。英國(guó)帝國(guó)理工學(xué)院近日發(fā)布新聞公報(bào)稱,該校研究人員開發(fā)出一種新方法,可有效解決上述問題。新方法將改變病體組織的檢測(cè)方式,從而推動(dòng)癌癥組織分析進(jìn)入數(shù)字時(shí)代。相關(guān)研究成果刊發(fā)在最新一期《美國(guó)國(guó)家科學(xué)院院刊》上。
質(zhì)譜成像技術(shù)主要是利用質(zhì)譜直接掃描生物樣品,分析化學(xué)成分在細(xì)胞或組織中的結(jié)構(gòu)、空間與時(shí)間分布信息。這種成像方法不局限于特異的一種或幾種蛋白質(zhì)分子,可在生物組織樣本中找到每一種蛋白質(zhì)分子,并提供它們?cè)诮M織中空間分布的精確信息。早在幾年前,就有科學(xué)家提出利用該技術(shù)來確定生物組織類型的構(gòu)想,但卻一直沒有設(shè)計(jì)出實(shí)用有效的方法。
新方法利用解吸電噴霧電離技術(shù)來優(yōu)化數(shù)據(jù)預(yù)處理,提高圖像精確度,并通過提取生物組織特定的分子印記來強(qiáng)化不同生物組織類型的生化特性,以增強(qiáng)圖像識(shí)別能力。研究人員稱,利用新開發(fā)的集成生物學(xué)信息平臺(tái),可將質(zhì)譜成像技術(shù)獲得的大量人體組織的具體信息數(shù)據(jù),用于構(gòu)建各種類型的組織數(shù)據(jù)庫(kù)。通過多樣本分析,并與傳統(tǒng)的組織學(xué)分析結(jié)果進(jìn)行比較,計(jì)算機(jī)就可以學(xué)習(xí)識(shí)別不同類型的組織,從而使癌變組織的解析變得相對(duì)簡(jiǎn)單高效。他們將自己設(shè)計(jì)的工作流程用于直腸結(jié)腸癌組織的檢測(cè),效果良好。
與標(biāo)準(zhǔn)組織學(xué)動(dòng)輒幾周才會(huì)得出完整結(jié)果的檢測(cè)手段相比,利用質(zhì)譜成像技術(shù)進(jìn)行單一檢測(cè),僅需幾小時(shí)即可獲得更詳盡的信息,不僅會(huì)顯示組織是否發(fā)生癌變,還會(huì)顯示癌癥是哪一種類型和亞型。這些信息對(duì)于醫(yī)生選擇最有效的治療方法十分重要。
研究人員指出,自19世紀(jì)后期染色技術(shù)用于顯示組織結(jié)構(gòu)以來,對(duì)組織病理學(xué)樣本的分析方法鮮有變化。直到今天,染色法依然是醫(yī)院組織學(xué)分析的主流手段,并且變得越來越復(fù)雜,耗費(fèi)也越來越高。而質(zhì)譜成像技術(shù)可能改變組織學(xué)的基本范式,科學(xué)家將不再根據(jù)組織的結(jié)構(gòu),而是根據(jù)它們的化學(xué)成分來定義組織類型。將來的檢測(cè)不再依靠專家的眼睛,而是以海量數(shù)據(jù)為基礎(chǔ),僅一個(gè)檢測(cè)所得到的信息就遠(yuǎn)比多個(gè)傳統(tǒng)組織學(xué)檢測(cè)所得到的更多。他們表示,新研究克服了一些質(zhì)譜成像技術(shù)實(shí)際應(yīng)用所遇到的障礙,將成為創(chuàng)建下一代完全自動(dòng)化的組織學(xué)分析手段的第一步。
總編輯圈點(diǎn)
這是用互聯(lián)網(wǎng)思維改造傳統(tǒng)檢測(cè)方法的一種嘗試,它首先選取了質(zhì)譜成像方法中最容易快速成像的解吸電噴霧電離技術(shù),實(shí)現(xiàn)了數(shù)據(jù)快速采集;其次,通過將質(zhì)譜成像得到的結(jié)果數(shù)字化,建立樣本庫(kù),提高了數(shù)據(jù)規(guī)模,保證了分析精度;最后,與大數(shù)據(jù)、云計(jì)算等結(jié)合,可不斷提高檢測(cè)的準(zhǔn)確性,為可靠應(yīng)用提供保證。新思維已經(jīng)提高了單個(gè)樣本的檢測(cè)精度,我們對(duì)它在群體和地區(qū)性疾病的檢測(cè)預(yù)防方面也應(yīng)有所期待。
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