美國Helicos BioSciences公司研究人員近日稱,他們開發(fā)出了一種新型的測序設(shè)備??單分子DNA測序儀(single-molecule DNA sequencers)。該儀器能夠“閱讀”單分子DNA的單個堿基。相關(guān)研究文章發(fā)表在4月4日的《科學(xué)》(Science)上。
傳統(tǒng)上,在測序之前,要先對DNA鏈進(jìn)行擴增。這一過程往往會引入錯誤,并且對某些DNA片斷來說無法很好地實現(xiàn),從而使得對整個基因組進(jìn)行測序變得尤為困難。
Helicos BioSciences公司以病毒M13為實驗對象,首先將它的基因組截成小的片斷,用一種酶將短小DNA標(biāo)簽附于每個片斷的末端,在適當(dāng)?shù)奈恢缅^定DNA片斷。之后加入DNA復(fù)制酶和帶有熒光標(biāo)簽的堿基或堿基對。當(dāng)熒光DNA形成鏈時,就用相機拍下每個新加上的堿基對。
這一新方法稱為“合成測序”,原則上與其它一些方法相同。不同之處在于,其它一些方法需要同時測序數(shù)千個相同的基因組片斷以使信號足夠“明亮”,新方法能夠偵測到單個堿基的熒光。
新方法避開了繁瑣的擴增過程,將能大大降低測序的時間和成本。Helicos BioSciences公司估計,新儀器能夠用8周的時間測序一個人的基因組,代價是7萬2000美元,而儀器本身則價值135萬美元。
美國能源部聯(lián)合基因組研究所主任Edward Rubin說:“這太酷了!最終,單分子測序?qū)⒊蔀橥ㄐ械姆椒?。?BR>
新的發(fā)現(xiàn)無疑又朝著1000美元/人的宏偉基因組測序計劃邁近了堅實的一步。論文第一作者Timothy Harris認(rèn)為,這一目標(biāo)將會在5年以內(nèi)實現(xiàn)。(《科學(xué)》(Science),Vol. 320. no. 5872, pp. 106 ? 109,Timothy D. Harris,Zheng Xie)
圖片說明:新方法測序無需進(jìn)行DNA擴增。
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